A SBL foi fundada em julho de 1982, durante Reunião Anual da SBPC na cidade de Campinas (SP). Promover o desenvolvimento da Limnologia Brasileira foi sempre uma das metas principais da SBL desde a sua formação.

A primeira diretoria da SBL foi integrada pelos seguintes sócios:

José Galízia Tundisi - Presidente
Francisco A. Rodrigues Barbosa - Vice Presidente
Mirna J. G. Orlandi - Segundo Secretário
Kozo Hino - Primeiro Tesoureiro
Raoul Henry - Segundo Tesoureiro

Desde então, a SBL tem sido conduzida pelos seguintes presidentes:
1 Presidente José Galizia Tundisi (1982 - 1984)
2 Presidente Francisco Barbosa (1984 - 1986)
3 Presidente Raoul Henry (1986 - 1988)
4 Presidente José Eduardo do Santos (1988 - 1990)
5 Presidente Carlos Bicudo (1990 - 1995)
6 Presidente Francisco Barbosa (1995 - 1997)
7 Presidente Sidnei M. Thomaz (1999 - 2001)
8 Presidente David Motta Marques (2001 - 2003)
9 Presidente Fabio Roland (2003 - 2005)
10 Presidente Ricardo M. Pinto Coelho (2005 - 2007)
11 Presidente Albano schwarzbold (2007 - 2009)
12 Presidente Raoul Henry (2009-2011)

Sócios fundadores da Sociedade Brasileira de Limnologia (SBL), fundada em julho de 1982, que tem proporcionado enormes avanços a esta ciência. Cortesia de Fukuara (Japão)

1) Edição do principal jornal científico na área de Limnologia no Brasil, ou seja, a Acta Limnologica Brasiliensia , agora também no formato eletrônico. A SBL também edita duas outras publicações.

2) O Boletim da SBL é voltado para a divulgação de notícias de interesse junto comunidade de limnólogos brasileiros.

3) A série Limnotemas é uma outra publicação periódica voltada à difusão do conhecimento limnológico principalmente de revisões bibliográficas ou novas metodologias.

4) Manutenção do portal da SBL.

5) Apoio a eventos científicos, dentre eles os congressos brasileiros de Limnologia que ocorrem a cada dois anos.

6) Hoje, a SBL persegue novas metas voltadas para uma maior inserção dos limnólogos junto aos grandes temas nacionais ligados à gestão dos recursos hídricos bem como têm atuado intensivamente no sentido de ampliar e estreitar as relações internacionais ligando nossos limnólogos com profissionais afins atuam seja na América Latina bem como em outros continentes.

O próximo congresso da SBL acontecerá acontecerá em Natal, Estado do Rio Grande do Norte, em data ainda a ser confirmada (agosto ou setembro de 2011).

O ano de 1995 representou um marco para a SBL. Naquele ano foi realizado, na cidade de São Paulo, o XXVI Congresso Internacional de Limnologia. A SBL foi a organizadora do evento, o qual teve a participação de aproximadamente 2000 pesquisadores, na sua maioria estrangeiros.

Além da sua diretoria, renovada a cada dois anos, a coordenação da SBL conta ainda com o conselho consultivo e representantes institucionais. Os Limnólogos associados à SBL atuam em diversas instituições do país distribuídas por todas as regiões geográficas e contribuem localmente para o êxito da SBL. Hoje, com mais de 600 associados, a SBL contribui para o desenvolvimento das atividades de pesquisa em ecossistemas aquáticos continentais, estimula o uso racional e a conservação de recursos naturais.

Em Dezembro de 2009 foi decidida, por mais de dois terços dos sócios da SBL, a extinção desta Sociedade e doação de seu patrimônio à sociedade congênere, como consequência de uma necessidade de adequação ao novo Código Civil Brasileiro. E em Agosto de 2010 foi fundada a Associação Brasileira de Limnologia (ABLimno), que manterá as funções e relações com os sócios da SBL.